Harjumaal nimetas ühistranspordikeskus suurimateks probleemideks, et Atko Liinide bussid ei ole korras ning bussijuhtidel on suur koormus. Majandusministeerium algatas Atko Liinide suhtes haldusmenetluse, mille käigus võib teoreetiliselt firma tegevusloa peatada. See tähendaks seda, et ühistranspordikeskus peaks liinidele leidma uue vedaja, kuid sellel peaks olema välja panna 60 uut bussi.
Selgub, et isegi kui osaühing Atko Liinid tegevusloa kaotaks, siis Viljandimaad see ei mõjutaks, sest siin tegutseb aktsiaselts Atko Bussiliinid. Viljandimaa ühistranspordikeskuse juhatuse liikme Kaupo Kase sõnul Viljandimaal busside korrasolekuga muret ei ole, sest siin kandis vuravad ringi vaid aasta vanad bussid.
Atko Liinid teeb ATKO Grupi kodulehe andmeil bussivedusid Harjumaal, Paides ja Saaremaal ning Atko Bussiliinid Ida-Virumaal, Jõgevamaal, Pärnumaal, Valgamaal ja Viljandimaal.